刀鱭（Coilia nasus）是一種珍貴的江海洄游魚類，具有重要的經(jīng)濟(jì)價(jià)值。從基因組層面進(jìn)行影響刀鱭洄游的分子生物學(xué)機(jī)制研究，有利于了解魚類洄游這一生物學(xué)特性，也有助于從分子層面解析洄游適應(yīng)性。中國水產(chǎn)科學(xué)研究院淡水漁業(yè)研究中心徐跑研究員領(lǐng)銜的“長江特色水生動物繁養(yǎng)創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)”，聯(lián)合華大海洋研究院歷經(jīng)4年的努力，首次完成了刀鱭全基因組測序、精細(xì)圖譜繪制和種群重測序，研究論文“Genome and population sequencing for a chromosome-level genome assembly of Chinese tapertail anchovy (Coilia nasus) provide novel insights into migratory adaptation”在國際重要刊物《GigaScience》雜志2020年第1期發(fā)表（https://academic.oup.com/gigascience/article/doi/10.1093/gigascience/giz157/5694102?guestAccessKey=dd75f2cd-8435-473e-9705-2c3b0c72b3af）。

該研究開展刀鱭染色體水平組裝的基因組和種群測序?yàn)殇в芜m應(yīng)性提供了新的見解，該研究發(fā)現(xiàn)刀鱭體內(nèi)的三條對洄游適應(yīng)性有顯著影響的鈣離子代謝相關(guān)通路，分別是鈣離子信號通路、MAPK信號通路和Wnt信號通路，表明洄游適應(yīng)主要與生殖適應(yīng)、長距離遷移適應(yīng)和復(fù)雜的環(huán)境適應(yīng)這3個(gè)水平的分子機(jī)制相關(guān)。這一研究結(jié)果為理解洄游適應(yīng)性和種群遺傳學(xué)提供了基因組學(xué)基礎(chǔ)，同時(shí)刀鱭基因組的破譯也有利于這種重要經(jīng)濟(jì)魚類的開發(fā)利用和增養(yǎng)殖管理。

淡水漁業(yè)研究中心徐鋼春研究員、華大海洋研究院卞超博士為該論文的共同第一作者，徐跑研究員和石瓊教授為該論文的通訊作者。

刀鱭的季節(jié)性洄游路徑

三條被富集到的鈣離子相關(guān)通路

三種鈣離子相關(guān)通路中所選基因的代表性mRNA轉(zhuǎn)錄情況和蛋白結(jié)構(gòu)改變

（水產(chǎn)養(yǎng)殖研究室供稿）