隨著新的海洋制度的建立，韓國近海捕撈作業區域逐漸縮小，遠洋漁業也面臨萎縮。為適應新形勢的變化，韓國政府已著手調整本國漁業結構，逐步由捕撈業向養殖業轉變，進一步促進水產業的發展。

２００１年韓國海水魚養殖面積１５７７ｈｍ２，主要分布在全羅南道和慶尚南道，兩道養殖面積１２２７ｈｍ２，分別占全國５１％和２７％；全國總產量９．１７萬ｔ，兩道產量合計７．０７萬ｔ，其中全羅南道占２２％，慶尚南道占５５％。陸地水槽式養殖牙鲆魚，養殖面積２３４．７６ｈｍ２，產量為３．９６萬ｔ，全羅南道占４３％，黑裙魚產量為３．９８萬ｔ，慶尚南道占４３％。

韓國水產養殖業無論在數量還是在質量上較過去都有明顯提高，其主要原因是牙鲆和黑裙魚的苗種生產技術已經過關，養殖技術不斷更新，政府鼓勵發展養殖的政策起到了一定作用。因此，魚類養殖正向多品種化發展，２００１年末有１８個養殖品種得到普及，有力地促進了養殖業的發展。

貝類養殖韓國１９９８年貝類養殖面積為４０１３４ｈｍ２，產量２３．９８萬ｔ，其中牡蠣產量為１７．５９萬ｔ、魁蚶為２．３０萬ｔ、菲律賓蛤為１．７２萬ｔ。目前牡蠣為主要品種，產量約占８０％。

貝類養殖從６０年代開始直到９０年代仍局限幾個品種，養殖區域大部分在南海岸，約占貝類產量的９０％，東海岸不足１％。為加大開發力度，韓國著手調整貝類養殖區域和品種，在東海岸試驗的品種主要有蝦夷扇貝、北蛤蜊、象拔蚌；在西海岸養殖蛤蜊、櫛孔扇貝、江珧貝、青蛤等；在南海岸重點養殖牡蠣、貽貝、紫石房蛤等。

藻類養殖韓國是藻類生產大國，１９９８年世界藻類產量８７５萬ｔ，韓國位于中國、菲律賓和日本之后，是世界第四藻類生產國。從品種來看，主要是紫菜、裙帶菜和海帶。２０００年全國藻類養殖面積６８２２８４ｈｍ２，其中紫菜５５５１１ｈｍ２、裙帶菜９２２４ｈｍ２、海帶１２０９ｈｍ２，分別占８１．３％、１３．５％和１．８％，３個品種占藻類養殖的９７％左右；從分布的地區來看，全羅南道為主產區，養殖面積５８８５９ｈｍ２，占８６％，其次是忠清南道３８３１ｈｍ２、全羅北道２５２３ｈｍ２、釜山１４０１ｈｍ２，分別占５．６％、３．７％和２％；從產量來看，２０００年藻類產量４２．９４萬ｔ，其中紫菜１８．５４萬ｔ、裙帶菜２１．２４萬ｔ、海帶１．４２萬ｔ、其他１．７４萬ｔ。

甲殼類養殖其主要品種為對蝦和車蝦，個別地區的梭子蟹養殖正處在試驗階段，因養殖技術還不過關，未形成規模。車蝦也因育苗用親蝦購買困難，加之病害嚴重，于１９９６年中斷養殖。近幾年主要以對蝦養殖為主，而且數量呈上升趨勢。１９９９年養殖面積１９４３ｈｍ２、２０００年２３４６ｈｍ２、２００１年２６０６ｈｍ２，產量分別為０．２萬ｔ、０．２９萬ｔ和０．３３萬ｔ，三年平均增長１５．６％。

韓國的對蝦養殖始于６０年代后期，７０年代開始人工育苗，并進行粗放式養殖，８０年代采用人工合成飼料集約化養殖，９０年代對蝦養殖技術不斷發展，但因規模擴大，魚病頻發，死亡率較高，產量不穩定。１９９９年至２００１年三年平均死亡率為６９．６％，嚴重影響對蝦養殖。

近幾年來，韓國水產養殖不斷發展，但也面臨許多問題，主要是：品種老化，養殖密度過大，病害頻繁發生，制約了養殖業的發展；飼料價格上漲，養殖成本提高，經濟效益明顯下降；魚價下跌，經營困難，從國外進口活魚增加，對市場沖擊較大。

為盡快解決養殖中存在的問題，韓國采取措施，積極探索多品種開發、多樣化消費的新路，促進養殖業的發展；大力推進種苗生產的產業化，不斷拓寬領域、擴大種苗規模；進一步強化養殖管理，杜絕非法養殖或不科學的盲目養殖現象；加速開發多種加工產品；提倡底質老化、病害嚴重的養蝦池實行“換茬、輪作”制養殖，切實保證養殖業可持續發展。