10月30日,記者獲悉,中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院生物技術(shù)研究所博士程奇帶領(lǐng)的課題組首次揭示了葉綠素生物合成關(guān)鍵酶——光依賴型原葉綠素酸酯氧化還原酶三維晶體結(jié)構(gòu),對認(rèn)識蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)如何控制重要光驅(qū)動酶的催化作用產(chǎn)生重大突破。該成果日前發(fā)表在頂級科學(xué)雜志《Nature》上。
“萬物生長靠太陽”,靠的就是光合作用,一切能為地球上生命所用的能量都是由太陽的光能轉(zhuǎn)化而來。光依賴型原葉綠素酸酯氧化還原酶作為藍(lán)細(xì)菌、藻類和多細(xì)胞植物葉綠素合成的關(guān)鍵酶。該酶的活性及其基因表達(dá)直接影響黃化幼苗的轉(zhuǎn)綠能力,對綠色植物的生長發(fā)育至關(guān)重要。雖然從發(fā)現(xiàn)這個關(guān)鍵酶至今大約近一百年了,但是科學(xué)家們卻一直沒有能夠揭開LPOR蛋白(光依賴型原葉綠素酸酯氧化還原酶)結(jié)構(gòu)的神秘面紗,因而對LPOR蛋白的作用機(jī)理也只是處于理論推測階段。LPOR蛋白的結(jié)構(gòu)及作用機(jī)理對光合作用的理論和應(yīng)用研究意義重大,是該領(lǐng)域亟待解決的重大科學(xué)問題之一。
中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院生物技術(shù)研究所博士程奇課題組和上海交通大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院博士周愛武團(tuán)隊與英國曼切斯特大學(xué)生物技術(shù)研究所博士Nigel Scrutton(奈杰爾·斯克魯頓)團(tuán)隊合作,研究發(fā)現(xiàn)了了LPOR酶單體,LPOR-NADPH(光依賴型原葉綠素酸酯氧化還原酶-煙酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸)蛋白復(fù)合體的晶體結(jié)構(gòu),衍射率分別為1.4,1.8,2.4。LPOR晶體結(jié)構(gòu)的闡明及其LPOR-NADPH-原葉綠素酸酯三元復(fù)合物的精準(zhǔn)建模研究,揭示了POR活性位點如何通過NADPH進(jìn)行局部氫化物轉(zhuǎn)移和沿結(jié)構(gòu)定義的質(zhì)子轉(zhuǎn)移途徑進(jìn)行遠(yuǎn)距離質(zhì)子轉(zhuǎn)移,促進(jìn)光驅(qū)動的原葉綠素減少。

LPOR-NADPH晶體結(jié)構(gòu)
至此證明,該酶活性位置的蛋白結(jié)構(gòu)高度調(diào)諧,促進(jìn)了光化學(xué)作用。它為如何利用光能驅(qū)動酶催化,提供了重要信息。
“本研究提供了LPOR蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和激發(fā)態(tài)化學(xué)之間關(guān)鍵的缺失環(huán)節(jié),對光催化的化學(xué)和生物催化劑以及相關(guān)蛋白小分子抑制劑的工程化設(shè)計具有重要意義?!痹摮晒餐ㄓ嵶髡叱唐姹硎?,這項工作也為提供定量的能量(光能到化學(xué)能)轉(zhuǎn)化反應(yīng)的詳細(xì)計算分析鋪平了道路,對該催化作用的描述將更加完整,這也是目前酶學(xué)的一大挑戰(zhàn)。
該成果共同第一作者中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院生物技術(shù)研究所博士孫文麗介紹,此項研究科學(xué)意義重大,由此揭秘了太陽提供給地球上一切生命的終極能量來源的生物學(xué)轉(zhuǎn)化“閥門”的真實結(jié)構(gòu)及其開關(guān)功能;光驅(qū)動酶的結(jié)構(gòu)學(xué)基礎(chǔ);光依賴型還原酶的動力學(xué)機(jī)制。
“本成果為諸多相關(guān)研究領(lǐng)域奠定研究的基礎(chǔ)——填補(bǔ)了國際上近一百年來光合作用相關(guān)領(lǐng)域的空白(葉綠素生物合成光驅(qū)動型酶LPOR及其輔因子NADPH復(fù)合體的三維晶體結(jié)構(gòu)),具有‘里程碑’的意義;有助于進(jìn)一步完善相關(guān)趨同進(jìn)化過程中的一些關(guān)鍵酶蛋白的進(jìn)化順序(地球鐘)和未來可預(yù)測性走向;有助于ATP(腺嘌呤核苷三磷酸)依賴型與光依賴(驅(qū)動)型酶工程化設(shè)計(新型固氮酶LUN、新型聚合酶Pol 等等)及相關(guān)領(lǐng)域的合成生物學(xué)基礎(chǔ)(生物固氮/光合作用)等?!背唐姹硎?。
據(jù)悉,該研究得到了國家973項目(2010CB126504)的資助。