自2013年11月水科院開展“三個專項”整治工作以來，院機關(guān)、院屬單位按照院黨組部署的專項整治任務(wù)，設(shè)立工作機構(gòu)，立說立行，邊查邊改，狠抓落實，一些群眾反映較多的問題得到有效整改，專項整治行動取得階段性成效。
一是嚴控三公經(jīng)費支出，制度保障進一步完善。在全院集中開展了“三公”經(jīng)費專項整治自查自糾、整改抽查活動。重點檢查“三公”經(jīng)費預(yù)算執(zhí)行情況。2013年，全院公務(wù)接待費開支顯著下降，公車購置和運行維護費用控制合理，因公出國（境）經(jīng)費未突破預(yù)算。院專項工作小組對部分單位進行了抽查和督促整改。各單位針對自查自糾中查擺的問題，認真分析原因，扎實推進整改。一方面采取針對性管控措施。如：公務(wù)接待安排在食堂就餐，嚴格控制陪同人數(shù)；通過招標主動實行“公務(wù)用車三定點”（定點保險、定點加油、定點維修）制度；嚴格按預(yù)算控制因公出國（境）支出等。另一方面強化制度建設(shè)。目前，院及院屬單位制、修訂了《公務(wù)接待和考察調(diào)研實施辦法》、《因公出國學習、進修和培訓管理暫行規(guī)定》、《經(jīng)費支出審批管理辦法》等一批規(guī)章制度，進一步完善了全院對嚴控三公經(jīng)費的制度保障。
二是定位科研不端行為根源，監(jiān)管懲戒進一步加強。在全院深入開展科研不端行為專項整治活動。在全院范圍內(nèi)發(fā)放了《學術(shù)腐敗行為調(diào)查問卷》，就學術(shù)腐敗行為具體表現(xiàn)、影響程度、產(chǎn)生原因、防治措施和相關(guān)建議進行深入調(diào)查，匯總分析調(diào)查結(jié)果，形成《院學術(shù)腐敗行為調(diào)查情況報告》。院成立了專項檢查組，就各研究所落實科研行為不端專項整治工作進行了督察。按照針對行為根源對癥下藥的整改原則，院制定印發(fā)了《科研不端行為監(jiān)督管理辦法（試行）》，進一步強化了全院對科研不端行為的監(jiān)管懲戒力度。
三是嚴查科研經(jīng)費管理缺漏，整改舉措進一步深化。重點對院屬研究所來源于中央財政撥款的各類科研項目經(jīng)費使用情況進行檢查，查擺了在科研經(jīng)費使用及管理中存在的主要問題，深入分析問題原因，在全院提出并推進落實進一步加強預(yù)算執(zhí)行管理，健全科研經(jīng)費管理制度，完善監(jiān)督和問責機制，加強現(xiàn)金管理、規(guī)范公務(wù)卡使用，提高財務(wù)隊伍整體業(yè)務(wù)水平和職業(yè)素養(yǎng)，提高科研人員財務(wù)規(guī)范意識、加強部門間溝通配合，加強管理系統(tǒng)的開發(fā)和建設(shè)等六個方面的整改措施，推進科研經(jīng)費相關(guān)配套管理舉措進一步深化。
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