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    863計劃“鯉魚和草魚等重要養殖魚類功能基因組研究及應用”階段性驗收會議舉行
    2012-03-06 00:00:00  來源:

    2月28日,863計劃“鯉魚和草魚等重要養殖魚類功能基因組研究及應用”項目階段性驗收會在北京舉行。驗收會由中國農村技術開發中心白衛濱博士主持,與會專家包括中國科學院水生生物研究所桂建芳研究員、中國海洋大學包振民教授、北京大學劉東研究員、中國科學院遺傳與發育研究所陳良標研究員、中國科學院北京基因組研究所于軍研究員、章張研究員等,國家自然科學基金委員會計劃局局長孟憲平、副院長李杰人、院學科發展處處長徐瑞永、科研計劃處處長劉英杰等出席會議。

    項目首席科學家孫效文研究員作了題為“鯉全基因組測序與遺傳育種工具開發”的工作匯報。項目對鯉魚全基因組進行了測序與裝配,進行了基因注釋,獲得的階段性研究成果包括:(1)完成了200倍覆蓋度的全基因組測序;(2)裝配獲得鯉魚基因組框架圖譜,其中contig N50為28 kb,scaffold N50為657 kb;(3)注釋獲得基因36412個;(4)建立BAC文庫,包含92160個BAC克隆,平均長度141 kb,覆蓋7.7倍鯉魚基因組;測序獲得75744個BAC末端序列;(5)構建了鯉魚基因組物理圖譜,包含3696個重疊群,N50長度達688 kb;(6)識別微衛星位點9.2萬個,cSNP位點77.8萬個;(7)建立了鯉魚高密度連鎖圖譜,由1058個微衛星標記和3819個SNP標記組成;(8)建立了鯉魚-斑馬魚比較基因組圖譜;(9)獲得食物轉化率、肌纖維、體重等24個性狀的QTL區間480個,主效基因376個;(10)建立了鯉魚基因組資源數據庫和網站。

    專家組審查了相關材料,觀看了鯉魚基因組數據庫網站的演示,經深入討論,一致認為該項目系統全面地開展鯉魚基因組資源挖掘,覆蓋了包括全基因組測序、基因注釋、圖譜構建、轉錄組分析、經濟性狀QTL分析、數據庫群構建等工作,在整體上達到了水產動物基因組研究的國際領先水平。建議項目組加快研究步伐,加強國內外合作,將獲得的基因組資源用于鯉的分子育種研究。


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