日前,由中國水產(chǎn)科學(xué)研究院淡水漁業(yè)研究中心水產(chǎn)遺傳育種研究室蘇勝彥博士等人發(fā)明的“DNA compare software 1.0”獲得國家版權(quán)局的計算機軟件著作權(quán)授權(quán)登記,授權(quán)號:2013SR112380。
本平臺通過構(gòu)建MySQL數(shù)據(jù)庫和依據(jù)Smith Waterman 算法進行序列比對,開發(fā)了DNAcomparisons1.0,開發(fā)語言使用JAVA,源代碼可在Windows,Unix和Linux上使用。根據(jù)使用者的需要,可依據(jù)相似度分值進行排序和選擇,對輸入的待檢測序列可以選擇一條或是多條,對輸出結(jié)果的多少也可進行數(shù)量的選擇,并提供如果待檢測序列是新品種序列的話,可根據(jù)入庫的編碼要求,進行登記入庫。入庫序列采用FASTA格式。同時該庫具有按照條形碼種質(zhì)鑒定的要求使序列標準化的功能。