大黃魚是我國產(chǎn)量最高的海水養(yǎng)殖魚類，年產(chǎn)量超過25萬噸。隨著近幾年大黃魚產(chǎn)業(yè)的轉(zhuǎn)型升級以及深遠海養(yǎng)殖的快速發(fā)展，優(yōu)良品種創(chuàng)制顯得尤為迫切。為解決產(chǎn)業(yè)難點，創(chuàng)建深遠海養(yǎng)殖大黃魚精準高效育種技術體系，中國水產(chǎn)科學研究院東海水產(chǎn)研究所海水養(yǎng)殖生物育種與可持續(xù)產(chǎn)出全國重點實驗室大黃魚遺傳育種團隊成功研發(fā)“東海芯1號”大黃魚15K基因組育種芯片。這是東海所為培育適宜深遠海養(yǎng)殖大黃魚新品種所特制的種業(yè)芯片，且檢測+預測周期小于14天，檢測成本不超百元。

“東海芯1號”育種芯片是基于大黃魚速生、高肌肉彈性和抗流選育參考群體（每個群體樣本數(shù)量均≥300尾）高深度重測序數(shù)據(jù)及2000余尾液相芯片分型數(shù)據(jù)，結(jié)合GenoBaits?技術體系開發(fā)而成，包括1173個GWAS分析性狀關聯(lián)標記，以及14119個基于遺傳連鎖關系挑選的基因組均勻分布的背景位點。該技術能夠?qū)崿F(xiàn)大黃魚快速、精準、高效的分子育種，可加快育種過程，提高育種效率，進一步推動大黃魚種業(yè)創(chuàng)新與產(chǎn)業(yè)高質(zhì)量發(fā)展。

“東海芯1號”芯片由東海所與博瑞迪聯(lián)合研發(fā)，研發(fā)過程中得到了廈門大學徐鵬教授團隊、中國水產(chǎn)科學研究院漁業(yè)工程研究所許建研究員團隊的技術支持。該芯片具有基因組上均勻分布、高多態(tài)性等特點，可以實現(xiàn)高效的群體劃分、分子標記輔助選育、全基因組選擇等諸多功能，部分性狀基因組選擇預測準確度最高可達0.66，證明該芯片在基因組選育中具有較好的應用前景。

近年來，東海所深化大黃魚全產(chǎn)業(yè)鏈聯(lián)合攻關，在育種方面與寧德市富發(fā)水產(chǎn)有限公司、廈門大學、中國水產(chǎn)科學研究院漁業(yè)工程研究所、浙江省舟山市水產(chǎn)研究所等單位合作，聚焦深遠海養(yǎng)殖大黃魚種業(yè)需求，創(chuàng)制了多個大黃魚新種質(zhì)和新品系。