大黃魚是我國產量最高的海水養殖魚類，年產量超過25萬噸。隨著近幾年大黃魚產業的轉型升級以及深遠海養殖的快速發展，優良品種創制顯得尤為迫切。為解決產業難點，創建深遠海養殖大黃魚精準高效育種技術體系，中國水產科學研究院東海水產研究所海水養殖生物育種與可持續產出全國重點實驗室大黃魚遺傳育種團隊成功研發“東海芯1號”大黃魚15K基因組育種芯片。這是東海所為培育適宜深遠海養殖大黃魚新品種所特制的種業芯片，且檢測+預測周期小于14天，檢測成本不超百元。

“東海芯1號”育種芯片是基于大黃魚速生、高肌肉彈性和抗流選育參考群體（每個群體樣本數量均≥300尾）高深度重測序數據及2000余尾液相芯片分型數據，結合GenoBaits?技術體系開發而成，包括1173個GWAS分析性狀關聯標記，以及14119個基于遺傳連鎖關系挑選的基因組均勻分布的背景位點。該技術能夠實現大黃魚快速、精準、高效的分子育種，可加快育種過程，提高育種效率，進一步推動大黃魚種業創新與產業高質量發展。

“東海芯1號”芯片由東海所與博瑞迪聯合研發，研發過程中得到了廈門大學徐鵬教授團隊、中國水產科學研究院漁業工程研究所許建研究員團隊的技術支持。該芯片具有基因組上均勻分布、高多態性等特點，可以實現高效的群體劃分、分子標記輔助選育、全基因組選擇等諸多功能，部分性狀基因組選擇預測準確度最高可達0.66，證明該芯片在基因組選育中具有較好的應用前景。

近年來，東海所深化大黃魚全產業鏈聯合攻關，在育種方面與寧德市富發水產有限公司、廈門大學、中國水產科學研究院漁業工程研究所、浙江省舟山市水產研究所等單位合作，聚焦深遠海養殖大黃魚種業需求，創制了多個大黃魚新種質和新品系。