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    珠江所在禾花鯉遺傳多樣性領(lǐng)域取得新進(jìn)展
    2022-08-04 15:55:19  來源:珠江水產(chǎn)研究所

    近日,珠江水產(chǎn)研究所生物技術(shù)研究室朱華平研究員團(tuán)隊(duì)在《Frontiers in ecology and evolution》(IF2021=4.493,JCR 2區(qū))發(fā)表了題為“Genetic sources and diversity of the paddy field carp in the Pearl River basin inferred from two mitochondrial loci”的研究論文。該研究得到國家自然科學(xué)基金(32072971)、廣州市科技計(jì)劃項(xiàng)目(202002030370)等項(xiàng)目資助。珠江所為論文第一完成單位,鐘再選博士為論文的第一作者,馬冬梅副研究員和朱華平研究員為論文的通訊作者。

    禾花鯉是在傳統(tǒng)農(nóng)業(yè)系統(tǒng)中與水稻共養(yǎng)的重要經(jīng)濟(jì)魚類之一,經(jīng)歷了長期的養(yǎng)殖和選育,已形成多個(gè)極具特色的禾花鯉品種,例如“金邊鯉”、“曬江鯉”和以及我所選育的禾花鯉“乳源1號(hào)”新品種等。然而,目前對(duì)于禾花鯉的種質(zhì)資源狀況、多樣性及遺傳分化情況研究甚少。

    本研究共采集了18個(gè)群體共計(jì)524尾禾花鯉樣本,包括普通稻田鯉、乳源1號(hào)、金邊鯉、曬江鯉和紫鯉等。結(jié)合多種分析(單倍型網(wǎng)絡(luò)分析,群體遺傳多樣性分析和Mantel檢驗(yàn))對(duì)禾花鯉的遺傳結(jié)構(gòu)和遺傳多樣性展開研究。單倍型網(wǎng)絡(luò)分析結(jié)果顯示,分別有1個(gè),9個(gè),57個(gè)單倍型來源于西鯉(Cyprinus carpio carpio),遠(yuǎn)東鯉(Cyprinus carpio haematopterus)和華南鯉(Cyprinus carpio rubrofuscus)。群體內(nèi)部遺傳分析發(fā)現(xiàn),金邊鯉的三個(gè)群體內(nèi)部發(fā)生顯著地較高的遺傳分化。群體間遺傳分析表明五種禾花鯉都存在不同程度的遺傳分化。其中,乳源1號(hào)的單倍型多樣性最低(0.559),且其與其他四種禾花鯉存在極顯著的遺傳分化。這可能是由長期的、高強(qiáng)度的人工選育導(dǎo)致。

    本研究揭示了珠江水系禾花鯉的遺傳多樣性和種質(zhì)來源現(xiàn)狀,探討了在禾花鯉選育中潛在問題,從而為禾花鯉的種質(zhì)資源保護(hù)、人工選育及資源的合理開發(fā)利用提供科學(xué)依據(jù)。

    文章鏈接:https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fevo.2022.896609/full

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