近日，院生物技術(shù)研究中心在鯉抵抗嗜水氣單胞菌感染的分子機(jī)制方面取得新進(jìn)展，相關(guān)研究論文“Genomic features of common carp that are relevant for resistance against Aeromonas hydrophila infection”發(fā)表于水產(chǎn)類1區(qū)雜志《Aquaculture》（2020年JCR1區(qū)，IF=4.242）。該論文得到國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃（2018YFD0900102）和中國(guó)水產(chǎn)科學(xué)研究院中央級(jí)公益性科研院所基本科研業(yè)務(wù)費(fèi)專項(xiàng)資金（2018B003和2020TD24）資助。江炎亮副研究員為文章的第一及通訊作者，許建研究員為共同通訊作者。文章鏈接網(wǎng)址：https://authors.elsevier.com/sd/article/S0044-8486(21)01175-3.

嗜水氣單胞菌是鯉魚(yú)養(yǎng)殖中危害最嚴(yán)重的致病菌之一。研究人員對(duì)易感和抗病的鯉魚(yú)進(jìn)行全基因組重測(cè)序并開(kāi)展全基因組關(guān)聯(lián)分析，定位到8個(gè)與抗病性狀顯著關(guān)聯(lián)的SNP位點(diǎn)（圖1），并進(jìn)一步找到6個(gè)潛在關(guān)鍵基因，均為免疫相關(guān)基因：rab26，dcc，trim71，ptpn21，muc5b，trim25。8個(gè)顯著關(guān)聯(lián)的SNP中，有1個(gè)為非同義SNP，位于基因trim25的外顯子區(qū)域，可引發(fā)Trim25蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)的改變（圖2），且該基因在經(jīng)嗜水氣單胞菌感染后的鯉魚(yú)脾臟中顯著上調(diào)表達(dá)。研究結(jié)果表明鯉在基因組水平上的遺傳差異決定了其抵抗細(xì)菌感染的能力強(qiáng)弱，為全基因組選育鯉抗病新品系提供了必要的分子基礎(chǔ)。

  圖1. Manhattan 結(jié)果展示圖

      圖2. Trim25 蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)