近日,珠江水產(chǎn)研究所觀賞漁業(yè)研究室牟希東副研究員等研發(fā)的“Fish NPCL Database on Web V1.0”(登記號:2019SR0557422。)和“Fish Simple Sequence Repeat Analysis Tool V1.0”(登記號:2019SR0625728)獲國家版權局計算機軟件著作權登記證書。
此次登記的2個軟件是在前期5個軟件(Fish Nuclear Protein Coding Loci detection V1.0、Fish Nuclear Protein coding Loci Primer Evaluation Program、Molecular Evolution Estimate Tool of Fish V1.0、Fish NPCL Database Search Tool V1.0和Fish Molecular Evolutionary and Differentiation Time Analysis Tool)的基礎上,進一步深化魚類核編碼基因標記的分析和評估應用。其中,F(xiàn)ish NPCL Database on Web V1.0是基于魚類編碼基因DNA分子標記數(shù)據(jù)庫,建立的序列查詢分析軟件,通過網(wǎng)站頁面,可實現(xiàn)分子標記的檢索,分子標記擴增引物查詢,物種分類進化檢索,物種分類鑒定等。Fish Simple Sequence Repeat Analysis Tool V1.0是基于魚類基因組數(shù)據(jù)/高通量測序數(shù)據(jù)檢測分析Simple Sequence Repeat(SSR)分子標記的軟件,適用于魚類SSR分子標記的實驗設計,標記檢測,引物設計,數(shù)據(jù)統(tǒng)計等,可實現(xiàn)對大量分子標簽進行篩選、實現(xiàn)高效、流程化分析。這兩個軟件均采用Python(2.7.x)編程語言開發(fā)完成,可在Linux操作系統(tǒng)和高性能計算集群(HPC)上運行,不僅在單臺計算機上安裝使用,而且可通過局域網(wǎng)絡和INTERNET進行遠程訪問使用。
