浮游細菌在水生生態系統生物地球化學循環中具有極其重要的作用，浮游細菌是河口水生態系統中的物質和能量循環系統中的關鍵環節。珠江河網、河口是獨特的生態系統，一方面受上游徑流的影響，同時也受潮汐海水頂托的影響，掌握其物質和能量循環的關鍵特征，是河網、河口生態系統安全保障和漁業水域保護與利用的關鍵。水域浮游植物、有機腐植質一方面由水生動物利用，另一些需要浮游細菌菌群分解，珠江所漁業環境保護研究室麥永湛博士根據團隊工作需要， 對珠江八大口門浮游細菌群落以及環境因子間的關系進行研究，分析了表層水浮游細菌群落的 β-變形菌、γ-變形菌和 α-變形菌等的組成，獲得浮游細菌物種多樣性具有明顯的季節差異結果，其中冬季 α 多樣性指數在呈上升趨勢（冬季Chao1指數1486.76±456.52；夏季Chao1指數762.51±162.48）；發現溫度、電導率、鹽度是驅動珠江口浮游細菌群落結構時空變化的主要環境因子；氨基酸、碳水化合物以及能量代謝的功能活性在冬季受到抑制，而涉及膜轉運，細菌遷移蛋白以及外源性物質的生物降解的功能基因相對豐度在冬季呈上升趨勢，說明珠江河口水文條件的時空變化引起的環境壓力可能加劇浮游細菌群落的種內和種間競爭，在河口浮游細菌群落功能研究上取得進展。以上研究成果發表在Marine Pollution Bulletin（Volume 136, November 2018, Pages 309-321）。